Информация на основе грамматического словаря А.Е.Полякова:
More detailed ▼wordforms:
1) глубины́ - единственное число, родительный падеж от глубина́.
2) глубины̂ - множественное число, именительный падеж от глубина́.
3) глубины̂ - множественное число, винительный падеж от глубина́.